Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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