Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1BQ9H0U4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1BQ9H0U4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms