Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC113Q9H0I3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms