Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms