Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM39BQ9GZU3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms