Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LNPKQ9C0E8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms