Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHACTR1Q9C0D0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR1Q9C0D0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms