Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM7Q9C029 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms