Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms