Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms