Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms