Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VN1R3Q9BXE9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms