Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM14BQ9BX40 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM14BQ9BX40 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM14BQ9BX40 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM14BQ9BX40 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM14BQ9BX40 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM14BQ9BX40 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSM14BQ9BX40 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms