Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIGD2AQ9BW72 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms