Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms