Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC39A3Q9BRY0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A3Q9BRY0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms