Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms