Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC77Q9BR77 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC77Q9BR77 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms