Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM83CQ9BQN1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM83CQ9BQN1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms