Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms