Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TREX2Q9BQ50 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms