Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX50Q9BQ39 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms