Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNS3Q9BQ31 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms