Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPAT1Q99943 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms