Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A3Q99624 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A3Q99624 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms