Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP19Q99542 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP19Q99542 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms