Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRBNQ96SW2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms