Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACCSQ96QU6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACCSQ96QU6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACCSQ96QU6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACCSQ96QU6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACCSQ96QU6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACCSQ96QU6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACCSQ96QU6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms