Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A9Q96Q91 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms