Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARAP1Q96P48 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARAP1Q96P48 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms