Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms