Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms