Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA13Q96N96 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA13Q96N96 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms