Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC43Q96MW1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC43Q96MW1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC43Q96MW1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms