Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf66Q96MD2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms