Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC7Q96M83 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC7Q96M83 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms