Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNPC3Q96LT9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNPC3Q96LT9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms