Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM47Q96LD4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms