Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
EP400Q96L91 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms