Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C4orf36Q96KX1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4orf36Q96KX1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms