Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms