Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms