Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERAC1Q96JX3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms