Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
BORCS6Q96GS4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms