Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC35A4Q96G79 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms