Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC97Q96F63 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms