Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms