Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPDL1Q96EA4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms