Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MTERF3Q96E29 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MTERF3Q96E29 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms