Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM5Q96DZ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMTM5Q96DZ9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms